La MRC de Beauharnois-Salaberry est administrée par un conseil de sept membres formé des maires de chacune des sept municipalités du territoire. Élu par ses pairs pour un mandat de deux ans, le préfet préside les séances du conseil qui se tiennent à la salle du Conseil de l'Hôtel de Ville de Beauharnois situé au 660 de la rue Ellice. Ces séances sont publiques et se tiennent le troisième (3^ième) mercredi de chaque mois à compter de 19 h 30, sauf en juillet, où il y a vacance, en novembre, où la séance du conseil est fixée au dernier mercredi du mois et en décembre, où la séance est prévue pour le deuxième mercredi du mois.